Agenti jsou roztroušeni po celé galaxii, kdy jeden tým operuje na Zemi a druhý letí do vesmíru najít Fitze. Zároveň společně pracují na tom, aby se vzpamatovali ze smrti Coulsona a znovu fungovali jako jeden tým.

Fitz a Enoch zápasí ve vesmíru, zatímco Sarge a jeho tým se posunují dále se svým tajemným plánem se Zemí.

Pro agenty je to bouřlivá noc na planetě Kitson. Zatímco Fitz a Enoch zkoušejí své štěstí v kasinu, v blízkosti Daisy a Simmonsové se objeví... mnohem zajímavější situace.

Yo-Yo a Keller se rozhodnou veřejně přiznat ke svému vztahu, parazitní cizinci ohrožují lidskou rasu a Sequoia shání bobu.

Sarge má May, se kterou má velké plány, neznámá Chronicomka Altarah má Daisy, Enocha a Simmons ovou a už tu máme dvě planety, které potřebují zachránit.

Fitz a Simmonsová se probojovali prostorem, časem a alternativní realitou, aby se navzájem našli. A teď jsou si blíže než kdy jindy. Přesto jim shledání naruší jejich vnitřní démoni.

Fitz a Simmonsová mají další problém, a to u hazardních her. Tajemný cizinec jim a Enochovi nabídne cestu domů. Mezitím se agenti obrací s prosbou o pomoc na Sarge.

Tajemná Izel prozradí Fitzovi a Simmonsové, jaké konkrétní předměty chce hledat na Zemi, zatímco Daisy a Yo-Yo pomáhají Sargeovi, aby zabránili Shrikům ve zničení světa.

Není čas na to, aby se celý tým začal bavit o tom, co u nich bylo nového a co se stalo, protože mají planetu, kterou musí zachránit.

Párty je u konce a tým si znovu musí začít věřit, protože budou čelit hrozící zkáze a nepříteli, který je blíž, než si myslí.

Ze všeho toho vyslýchání a tím, že jim nezbývá dost času, musí agenti čelit duchům své minulosti, aby se mohli pohnout kupředu. Dostanou agenti včas odpovědi, aby mohli zachránit nejen Macka a Yo-Yo, ale i celý svět?

Yo-Yo a Mack jsou stále zavření ve chrámu s Izel, zatímco agenti se spojí se Sargem, aby jí společně čelili. Mezitím Jemma, Fitz a Deke nachází způsob, jak se dostat ke chrámu, aniž by použili jakékoliv letadlo z výbavy S.H.I.E.L.D.u.

Čas se krátí a tým bude muset jít do pekla a zpět, aby zastavil konec všeho. Kdo přežije?

Agenti už vědí, na jaké straně stojí Sarge a snaží se zastavit jak jeho tak i Izel. Deke se snaží dostat k Mackovi a Daisy, zatímco Jemmu a Fitze čeká v Majáku nemilá návštěva.

Coulson a agenti S.H.I.E.L.D.u u­víznou v roce v 1931 New Yorku. S nově nastavenou funkcí cestování časem v Zephyru, která se může spustit kdykoliv, musí tým spěchat, aby zjistil, co se přesně stalo. Pokud by selhali, znamenalo by to katastrofu pro minulost, současnost a budoucnost světa.

Když byla odhalena identita „vlákna“ v časové ose, poslání týmu chránit onoho člověka za každou cenu vede každého agenta k pochybnostem o svých vlastních hodnotách. Stojí zachování budoucnosti světa takového, jakého ho znají, za zničení, kterému by mohli zabránit?

Skok vpřed v čase zanechal Enocha v roce 1931 a tým přistál v další neznámé dekádě. Nyní, aby zabránili Chronicomům v zahájení jejich nejnovějšího plánu odstranění budoucnosti, budou agenti muset proniknout do jedné z nejzabezpeče­nějších základen S.H.I.E.L.D.u. Neuspějí ovšem bez pár známých tváří.

Bylo to jen další obyčejné ráno 22. července 1955, když si agent Phil Coulson uvědomil význam toho dne v historii S.H.I.E.L.D.u. Se závadou v jeho systému uvedl do pohybu řetěz událostí, který by mohl zachovat časovou osu, jak ji známe, a zajistit, že ti otravní Chronicomové dostanou, co si zaslouží. Co by se mohlo pokazit?

Po drsném přistání v disco době se tým – s Danielem Sousou za zády – spojí s více než jednou známou tváří ze S.H.I.E.L.D.u a zjistí, jak přesně zničit poslední plán Chronicomů. Ale když se dostanou hodně blízko, Zephyr neočekávaně skočí v čase, tentokrát do dne klíčového nejen pro budoucnost S.H.I.E.L.D.u ale také pro budoucnost ředitele Macka.

Poté, co si tým S.H.I.E.L.D.u zni­čil svoje krytí a ve stejný moment i poškodil Zephyr, musí tým bojovat o to, aby zachránili rodiče Macka, S.H.I.E.L.D. od napadení Chronicomů a opravit loď. To vše musí zvládnout před dalším časovým skokem. Mezitím se Daisy a Sousa ocitnou v jisté nevýhodě oproti Nathanielu Malickovi, který prahne po moci a Coulson bude muset udělat něco, v čem je velmi dobrý, aby zachránil budoucnost.

Poté, co Mack a Deke nečekaně uvíznou v roce 1982, se Mack rozhodne vyrazit do svého domova z dětství, aby patřičně zpracovat smrt svých rodičů, zatímco Deke začne spolupracovat se skupinou nových agentů a prozkoumávat okolí. Bez nápadu, zda nebo kdy se tým pro ně vrátí, se tdá, že čas je konečně na jejich straně. Alespoň do doby, než se objeví zabijačtí roboti.

Při nefunkčnosti pohonu času na Zephyru se na tým doslova nabaluje katastrofa a Yo-Yo může být jejich jedinou nadějí. Jediný problém? Aby získala své síly zpět, bude muset získat pomoc starého protivníka a navrátit se do své staré minulosti.

Časová bouře pustoší Zephyr, je poháněná směrem k destrukci a současně nutí Daisy a Coulsona znovu prožít neúspěšné pokusy zachránit tým znovu a znovu, dokud nenajdou řešení, nebo nebudou polknuti samotnou bouří. Bude za potřeby důvěra, odvaha a oběť od všech na palubě, aby se dostali do další destinace. Vše ale nakonec povede k tomu, aby měli dostatek času.

Poté, co je Enochova oběť vyhodila z časové bouře, tým dorazí zpět do roku 1983, kde Nathaniel a Kora těžce pracují na sestavení armády pečlivě vybraných anarchistů Inhumans v Ráji. Když se agenti rozdělí, aby pokryli více místa, Daisy má za úkol chránit Ťia-jing a je nucena konfrontovat svou matku poprvé od její smrti, zatímco ostatní rychle zjistí, že budou muset čelit dalšímu mocnému bývalému nepříteli, aby zastavili Malicka.

S pomocí Kory uvnitř základny Majáku pokračují Sibyl a Nathaniel ve svém boji za utváření temné nové budoucnosti pro S.H.I.E.L.D. Pokud se je bude chtít tým pokusit obejít, bude muset být kreativní a to ve všech směrech.

Agenti, kteří jsou v pasti díky Nathanielovi a Sybil a jejich eliminaci S.H.I.E.L.D.u z his­torie, se musí spoléhat na své silné stránky, aby přechytračili a překonali Chronicomy.

Toto je jejich nejdůležitější boj a přežití bude vyžadovat pomoc přátel a spolupracovníků, minulých i současných.