FBI-Agent Dale Cooper hat im roten Raum eine Begegnung mit der getöteten Laura Palmer: Sie offenbart ihm, dass er den Raum erst verlassen kann, wenn sein böser Doppelgänger dorthin zurückgekehrt ist. Der will das allerdings keinesfalls und hat andere Pläne: Er sucht in South Dakota nach rätselhaften Koordinaten. Deputy Sheriff Hawk macht unterdessen im Wald, wo Agent Cooper verschwand, eine merkwürdige Entdeckung.

Coopers Doppelgänger hat den Angriff überlebt und wird von zwei Komplizen wieder zusammengeflickt. Unterdessen nimmt die Polizei in Las Vegas den echten Coop genauer unter die Lupe. FBI-Vizedirektor Cole legt einen Zwischenstopp in South Dakota ein, wo einer der Toten als der vor 25 Jahren verschwundene Major Briggs identifiziert wurde. In Twin Peaks erhalten die Sheriffs von der Witwe des Majors eine Kapsel mit einer rätselhaften Botschaft.

FBI-Vize Gordon Cole und Agent Rosenfield wollen die inoffizielle „Blue Rose Task Force“ reaktivieren, die übernatürliche Fälle untersucht, und weihen FBI-Frischling Tammy Preston ein. Coopers Sekretärin Diane wird wegen mysteriöser Textmessages von Rosenfield überwacht. In Twin Peaks verhält sich Laura Palmers Mutter immer unberechenbarer. Der Ärger um ihren kriminellen Sohn ruft unterdessen Audrey Horne auf den Plan.

Agent Coopers böser Doppelgänger verfolgt Rays Spuren bis zum Unterschlupf seiner Gang in Montana. Er will endlich die Koordinaten – und sich an ihm rächen. In Las Vegas unternimmt Anthony Sinclair einen weiteren Versuch, den guten Cooper alias Dougie Jones zu beseitigen. In Twin Peaks kommen sich Dr. Jacoby und Nadine näher, während Audrey ihr Haus nicht mehr verlässt.

Coopers böser Doppelgänger versucht den verschwundenen FBI-Agenten Phillip Jeffries zu kontaktieren, von dem er sich einige Antworten erhofft. In Twin Peaks trifft Norma eine Entscheidung für ihre Zukunft – und für die von Big Ed. Die todkranke Log Lady hat eine letzte Prophezeiung für Deputy Hawk. In Las Vegas ruft eine Szene aus einem Hollywood-Klassiker beim guten Dale Cooper alias Dougie Jones folgenreiche Erinnerungen wach.

Coopers Doppelgänger ist auf dem Weg zu dem Ort, den die gesuchten Koordinaten markieren. Unterwegs gabelt er den flüchtigen Richard Horne auf, der nicht ahnt, dass er seinen Vater vor sich hat. Der echte Cooper alias Dougie Jones fällt nach einem Stromschlag ins Koma – und erwacht daraus völlig verändert. In einer Vision erhält er eine Botschaft vom einarmigen Mann. Coopers Ex-Sekretärin Diane macht unterdessen FBI-Vizechef Gordon Cole ein furchtbares Geständnis.