Enterprise se vydala na svou misi, ale první dny se jí příliš nedaří. Posádka čekala nové planety a nové civilizace, ale zatím její jediný první kontakt byl s malým slimákem, který umírá na ošetřovně. Hoshi se mezitím zabydluje na palubě, ale má s tím problémy. Například hvězdy v její kajutě se pohybují jiným směrem než při výcviku a proto požádá o přestěhování na druhou stranu lodi. Jak se zdá život na palubě hvězdné lodi jí příliš nesedí. Enterprise mezitím testuje zaměřovací systémy, ale ani zde nemají štěstí. Jsou rádi, že nejsou vlastními střelami sami zničeni. Když se vydají dál na cestu konečně na něco narazí - opuštěnou cizí loď. Archer s Reedem a Hoshi jako překladatelkou se vydávají ve skafandrech na průzkum. Na palubě, ale naleznou pouze 15 mrtvých těl, ze kterých jsou vysávány nějaké látky do cizího přístroje. Hoshi je zděšena a začne uvažovat o opuštění Enterprise a návrat na Zemi. K cizí lodi se ale mezitím blíží ten, kdo zabil její posádku...

Enterprise narazí na planetu, která se odtrhla od své "rodné" planetární soustavy a putuje vesmírem. Na povrchu je sice pořád noc, ale stále se na něm drží vegetace a fauna díky termálním proudům. Když je na povrchu detekována cizí loď, Archer se to rozhodne prozkoumat. Po přistání výsadek vstupuje do temné džungle a nakonec se setkává se zvláštní skupinou Eskanů, kteří jsou zde podle svých slov na lovu. Jejich muži cestují na tuto planetu, aby zde lovili prasatům podobná stvoření. Eskané tvrdí, že vyšší primáty nechávají na pokoji. Ačkoliv se to Archerovi příliš nelíbí, dovolí Reedovi, aby se připojil k lovu a dostal tak možnost prostudovat jejich senzory. Zatímco ostatní spí, na Archera kdosi zavolá. Když následuje hlas do džungle, zahlédne krásnou mladou ženu v noční košili, která rychle zmizí v křoví. Eskané se mu smějí, že si to s ním jenom zahrávala jeho představivost. Ale když je později Archer opět sám, zjeví se mu žena znovu. Tentokrát neuteče a naléhavě ho prosí o pomoc. Její lidé jsou měňavci a Eskané loví právě je...

Kapitán Archer chce navštívit kolonii Paraaganů a proto se tam s výsadkem vydá raketoplánem. Reed sice s rezervou dodrží všechna nařízení Paraaganů, ale přesto se jim při přistání podaří vznítit atmosféru, a to díky vysoké koncentraci prchavého plynu tetrazinu. Atmosféra je zničena stejně jako kolonie - všichni Paraagané zemřou.

Silik a jeho sulibanští vojáci obsadí Enterprise, aby našli kapitána Archera. T'Pol sice tvrdí, že kapitán zmizel právě ve chvíli, kdy se chtěl Sulibanům vzdát, ale Silik ji nevěří a tak ji podrobí výslechu a mučení. Mezitím Archer uvízl na zdevastované Zemi 31. století spolu s agentem Danielsem. Oba se pokoušejí zjistit, jak mohlo Archerovo zmizení ovlivnit historii natolik, že nevznikla organizace zvaná Federace...

Při odletu z mateřské planety Enolianů jsou Archer s Tripem omylem identifikováni jako pašeráci a bez prodlení zavřeni na vězeňskou loď, která právě míří do nápravné kolonie. Vězni nejsou jenom Enoliané, ale zločinci z celého okolí včetně jednoho Nausicaana. Na Enterprise se mezitím T'Pol snaží přesvědčit enolijské úřady, aby kapitána Archera a Tripa propustily. Po chvíli přesvědčování se jí to skutečně podaří a úřady souhlasí. Teprve nyní se však dozvídá, že oba už dávno míří k jiné planetě. V té chvíli se ale jeden z vězňů, Kuroda, osvobodí a podaří se mu zneškodnit všechny stráže a zabít pilota. Stává se neomezeným pánem deportační lodi a jako prvního osvobodí mohutného Nausicaana. Ostatní vězni ale zůstávají připoutáni k lavicím. Teprve když se Archer přihlásí, že je jediný, kdo dokáže řídit loď, Kuroda propustí i jeho a přinutí ho změnit kurz. Mezitím je začnou stíhat lodě Enolianů, kterým je jedno, že jsou na palubě dva nevinní, a začnou střílet...

K Zemi dorazí podivná cizí sonda, která bez varování vypálí na Zemi svůj smrtící paprsek, který se zařízne do oblasti od Floridy po Venezuelu a zabije milióny lidí.

Enterprise již šest týdnů pátrá uvnitř Delfské oblasti po záhadných Xindech, ale prozatím bezúspěšně. Posádka se mezitím sžívá s novými členy vojenské jednotky MACO, jejíž velitelem je major Hayes.

Enterprise konečně dorazí k Azati Prime, kde se má stavět xindská superzbraň. To se jim také potvrdí, když do systému přilétá Degrova loď v doprovodu dalších xindských lodí.

Archer s ostatními letí na Degrově lodi za superzbraní mířící k Zemi. Plánuje dostat se do zbraně, přetížit její energetické systémy a způsobit její předčasnou explozi. Je v podstatě úspěšný, ovšem zdá se, že ve výbuchu nezahynul, naopak, dostal se na nečekané místo do nečekaného času. V Delphském oblaku zatím T'Pol vede Enterprise do pokusu zničit sféru 41 v naději, že se tak zhroutí celá síť. Je to závod s časem, protože tato oblast vesmíru má degenerativní účinky na jejich těla a zuřiví Stavitelé sfér, transdimenzionální bytosti, se snaží roztrhat Enterprise na kusy.

Po zničení zbraně, kterou vyvíjeli Xindové, je Enterprise na cestě k Zemi. S velením Hvězdné flotily nemůže navázat kontakt, je tedy nutné na povrch vyslat raketoplán. Ten je však po vstupu do atmosféry okamžitě napaden starodávnými stíhačkami...

Archerovi se podaří spojit se s Enterprise a je transportován na palubu. Umírající Daniel mu řekne, že mimozemští spojenci nacistů jsou další frakcí studené časové války, která je přesvědčena, že má právo využívat technologii cestování časem k takovým změnám minulosti, které jim vyhovují. Na Zemi staví stroj času, jehož pomocí se chtějí vrátit. Vyspělejší technologie Enterprise by se hodila, a tak se jejich vůdce Vosk snaží získat Archera jako spojence. Archer však věří Danielsovi a vrací se na Zemi, kde za pomoci Silika, který proti časovým extremistům také bojuje, a domácího odboje stroj času zničí. Minulost se vrací do normálu a Daniels se s Archerem loučí s tím, že se zřejmě vidí naposledy. Enterprise se ocitá u Země na jaře roku 2154 a vstříc jí letí vše, čím Země disponuje.

Enterprise se vrací domů. Na posádku čekají oslavy ale i obviňování. Kapitán Archer musí čelit hněvu Vulkánců, zatímco odpor k mimozemšťanům na Zemi se zvyšuje.

T'Pol odlétá navštívit matku na Vulcan a bere Tuckera sebou jako hosta. Tam na ní ale čeká několik nepříjemných překvapení.

Enterprise vyhledá orionský korzár Harrad-Sar a učiní kapitánu Archerovi překvapivou a velmi dobrou nabídku: poskytne mu souřadnice planety s mimořádně bohatými ložisky magnezitu za 10 % zisku, až Federace vybuduje doly. Navíc slibuje, že se zasadí o zlepšení vztahů mezi Orionským syndikátem a Hvězdnou flotilou. Na znamení přátelství dá Archerovi dar - tři otrokyně. Orionky velmi rychle omámí všechny muže a inženýr Kelby pod vlivem jejich feromonů zcela vyřadí warp pohon. Harrad-Sar je na cestě zpět a je jasné, že cílem jeho operace bylo získat Enterprise a kapitána Archera, na jehož hlavu vypsal Syndikát odměnu. Trip je naštěstí díky spojení s T'Pol vůči orionským feromonům imunní, a tak je schopen ve spolupráci s ní plán Orionců překazit.

Komandér Riker stojí před důležitým rozhodnutím a poradkyně Deanna Troi mu poradí, aby strávil nějaký čas v simulátoru, kde třeba najde odpověď. Přehrává si příběh posádky úplně první vesmírné lodi Enterprise, která objevovala nové světy až do roku 2161. Archerův tým stál v onom památném roce u založení Spojené Federace planet...