Neznámá dívka s telepatickými schopnostmi, působícími jako neviditelné ruce, uteče z tajného zařízení. Následujícího dne ji najdou Kouta a Yuka, bratranec a sestřenice. Ale dívka je jiná než dřív. Může říct jen jedno slovo, nyuu. Bratranci o ní nic nevědí, ale přijmou ji k sobě. Kurama, hlavní vědec z oblasti, ze které unikla, za dívkou posílá nemilosrdného muže Banda.

Bando uteče z nemocnice a stále se snaží najít Lucy, aby uspokojil svou zášť vůči ní. Bezvládné tělo profesora Kakuzawa Yu je nalezeno jeho asistentem a Koutem. Při hledání Lucy se Kouta a Yuka navzájem sbližují, což se projevují polibkem. Nakonec Lucy najdou a odvezou zpět domů.

After Lucy is knocked out by Nana Kouta tends to her. She sleeps and relives her childhood in a dream, revealing many things about her. Meanwhile, Nana tells Mayu about Lucy and the diclonius and Arakawa is called in to work for Director Kakuzawa...

More of Lucy's past is revealed: Her meeting with Kouta, their friendship that will end in tragedy, and the reason why Lucy became the killer she is today.

Number 35, Mariko, is released and immediately kills the soldiers around her. The professors, who were prepared for this, set off one of the explosives inside her, destroying her arm. Later, they fly her to where Nyuu and Nana are. Meanwhile, Nana is enjoying living in the inn but Kouta tells her she needs to work as well. Things seem to be going as peaceful as it can get...