Virus Kiamat yang tercetus menyebabkan Jepun diperintah oleh GHQ. Pelajar sekolah tinggi Shu bertemu penyanyi idola Inori, tetapi dia diambil oleh tentera.

Yuu, penjaga kubur Daath, menggunakan bilah Void ke atas Gai dan mengambil Inori. Shu mengekori mereka dan terjumpa Keido yang bakal memulakan upacara tidak menyenangkan.

Kiamat keempat semakin menghampiri bertujuan membentuk evolusi dan pemilihan kepada mereka yang hidup di bumi. Kedua-duanya harus menamatkan persengketaan pada masa lalu.