Gleich nachdem Makoto Naegi das Gebäude der renommierten Eliteschule Hope‘s Peak Academy betreten hat, findet er sich in einem mörderischen Spiel mit vierzehn anderen Neuschülern wieder.

Es gibt die ersten beiden Toten. Der wahnsinnige Teddybär Monokuma meint es offenkundig todernst. Angst und Misstrauen machen sich breit. Makoto ist für die Anderen hoch verdächtig.