Als Astronomen aus den Tiefen des Weltraums ein Signal empfangen, ist dies der Beweis für die Existenz intelligenten außerirdischen Lebens. Schon bald wird die Erde brutal angegriffen.

Am Tag nachdem die Erde angegriffen wurde, machen sich die meisten Überlebenden auf den Weg ihre Angehörigen zu suchen.

Während sich der Staub auf ihrer schönen neuen Welt niederlässt, müssen sich die Überlebenden einigen kalten Wahrheiten stellen. Catherine ist verblüfft, die Rolle zu entdecken, die sie bei dem außerirdischen Angriff gespielt hat. Helen wird auf Rache fixiert. Und Emily gewinnt für einen Moment ihr Augenlicht zurück. Aber ist das Wunder Grund zum Feiern oder zur Sorge?

Catherine kann das Signal der Angreifer lokalisieren und weiß somit, dass sie sich in einem nahegelegenen Tal befinden. Doch der Weg dorthin ist nicht ungefährlich.

Es gibt Probleme, als die Überlebenden verschiedene Wege finden, um damit umzugehen. Jonathan ist zunehmend beunruhigt über Sachas seltsames Verhalten. Emily ist für Bill ein aufregendes Rätsel.

Die Überlebenden haben sich in die medizinische Fakultät zurückgezogen, damit Bill die tote außerirdische Kreatur weiter untersuchen kann.

Tragödien schlagen zu und verändern für immer den Verlauf der Zukunft. Katharinas Prioritäten ändern sich mit der Ankunft von Sophia. Zwischen Jonathan und Sacha spitzt sich alles zu. Und Emily ist so glücklich, dass sie wieder sehen kann.

Die Überlebenden versuchen, ein für alle Mal den Spieß umzudrehen. Mokrani und Catherine bereiten sich auf den Kampf ihres Lebens vor. Emily sucht um jeden Preis nach Antworten. Und Sachas Visionen gehen weiter und geben einen verwirrenden Blick auf die Zukunft.

Ein halbes Jahr nachdem Emily in einem Raumschiff der Außerirdischen verschwunden ist, haben die Überlebenden der Invasion in London eine Basis aufgebaut. Von hier aus wollen sie gegen die Aliens kämpfen. Mittlerweile haben die Angreifer aus dem All die Gestalt von Menschen angenommen. Wie ihnen das gelungen ist, bleibt sogar Bill zunächst ein Rätsel. Sicher ist nur: Der Krieg geht weiter. Inzwischen gelingt es Tom, seine Schwester Emily wiederzufinden. Diese muss feststellen, dass die Freude über ihre Rückkehr keineswegs ungetrübt ist.

Emily hat sich verändert. Offenbar gibt es merkwürdige Gemeinsamkeiten zwischen ihr und den Aliens. Zoe sieht darin eine unerwartete Chance. Sie versucht Bill klarzumachen, dass sich die ”neue” Emily für den Kampf gegen die Invasoren nutzen ließe. Derweil verfolgt die skrupellose Adina durchaus eigene Pläne mit dem Teenager: Emily scheint jedenfalls nicht ohne eine Zielvorgabe freigelassen worden zu sein. Derweil werden auch ihre Eltern Sarah und Jonathan von heftigen Problemen geplagt.

Bill injiziert Emily heimlich eine Substanz, die als biologische Waffe gegen die Außerirdischen wirken soll. Kurz darauf verschlechtert sich ihr Gesundheitszustand rapide. Emily braucht dringend Insulin. Einer Gruppe von Überlebenden gelingt es tatsächlich, ein entsprechendes Präparat aufzutreiben. Allerdings wird ein Mitglied der Gruppe während der Aktion von Aliens entführt. Kurz darauf greifen die Invasoren die Widerstandsbasis an und die Überlebenden sind gezwungen, London zu verlassen. Schließlich findet Emilys Familie heraus, was Bill getan hat.

Catherine, Nathan und Sophia erhalten unerwartete Unterstützung für die Rückkehr nach London. Doch der Weg ist nicht ungefährlich. Unterdessen suchen Adina, Reuben und die anderen Aliens nach Bill. Dabei müssen sie feststellen, dass auch sie nicht vor Gefahren gefeit sind - und plötzlich ist Isla verschwunden. Sacha spürt währenddessen, dass er sich immer mehr zu Emily hingezogen fühlt. Das führt automatisch zu einem Konflikt mit Bill.

Aus purem Selbstschutz hat sich Bill von der Gruppe entfernt. Mittlerweile hat er andere Überlebende getroffen. Ihnen erläutert er seinen Plan für den weiteren Kampf: Er will die Aliens mit Hilfe eines Virus beseitigen. Die Brutalität, mit der seine neuen Gefährten Isla behandeln, lehnt er allerdings ab. Kurz darauf greift er zu drastischen Mitteln, um die Außerirdische zu retten - und plötzlich arbeiten Bill und Isla zusammen. In der Zwischenzeit muss Chloe zu ihrem Schrecken erkennen, das sie die Kontrolle über ihren Sohn Sacha verloren hat.

In einem Universitätsgebäude hat Sophia Videos eines Menschen namens Dylan entdeckt. Dieser hat bis kurz vor seinem Tod das Verhalten der Außerirdischen erforscht. Auch Catherine beschäftigt sich mit seinen Untersuchungen. Bald finden die beiden heraus, wie es den Aliens gelungen ist, auf die Erde zu kommen. Unterdessen suchen Sarah und Jonathan fieberhaft nach Insulin. Um seinen Plan zu verwirklichen, will Bill derweil dringend mit Emily in Kontakt treten. Nur so kommt er an das Virus.

Chloe hofft verzweifelt, dass Sacha zur Gruppe zurückkehrt - auch wenn nun alle wissen, dass er für den Tod von Ash verantwortlich ist. Emily stimmt unterdessen zu, dass Bill weitere Virustests mit ihr durchführt. Doch dann hat die Behandlung unerwartete Folgen. Sacha ist außer sich und bereit, wirklich alles zu tun, um Emily zu schützen. Schließlich kehren Catherine und die anderen zu Bill nach London zurück. Gemeinsam finden sie nun weitere erschreckende Fakten über die Aliens heraus.

Bill und Catherine konfrontieren Isla mit erschreckenden Fakten über ihre außerirdische Heimat. Nun muss sie sich entscheiden: Auf welcher Seite steht sie? Während Isla nun Adina die für sie neuen Wahrheiten und schrecklichen Geheimnisse präsentiert, bereiten sich die Überlebenden der Alien-Invasion auf den alles entscheidenden Angriff vor. Die Aktion könnte den Verlauf der Ereignisse für immer verändern. Vor allem auf Bill lastet eine globale Verantwortung. Von seiner Entscheidung hängt jetzt das Schicksal der gesamten Erde ab.