In the near future, Panther Claw has destroyed the Tokyo Metropolitan Government. The capital government is forced to shift into the provinces. During this time, Honey Kisaragi has transferred to St. Chapel Academy as part of a special course. This special course is the "New Generation Honey" project, where students, including Honey, become Cutie Honey.

Num futuro próximo, a organização Garra de Pantera 'Panther Claw' destrói o Governo Metropolitano de Tóquio. O governo da capital é forçado a mudar-se para a província. Durante este período, Honey Kisaragi transferiu-se para a Academia Santa Capela como parte de um curso especial. Este curso especial é o projeto “Nova Geração Honey”, onde os alunos, incluindo Honey, se tornam Cutie Honey.