時代設定は江戸時代の天保初年。主人公は、動物専門の医者・新九郎。江戸は内藤新宿にある「えんま長屋」に、引っ越してきて「生き物一切医療仕り候　金魚、小鳥より牛、馬まで　但し人間お断り」という看板を掲げ住む。

正義感の持ち主であり、関係した事柄（事件）などに関連する悪人共を、長屋の住人と共に退治していく。