When the Teenage Mutant Ninja Turtles acquire Mutastones from Crys-Mu, the spirit of light, they acquire the ability to enhance themselves into Super Turtles for a duration of three minutes. Meanwhile, the evil Shredder and his minions Bebop and Rocksteady stumble upon the Dark Mutastone, which transforms them into Devil Shredder, Supermutant Bebop and Supermutant Rocksteady, respectively. But the Turtles have one more trick up their shells: all four of them can combine into their ultimate form—Turtle Saint.

Wanneer de Teenage Mutant Ninja Turtles Mutastones verwerven van Crys-Mu, de geest van het licht, verwerven ze het vermogen om zichzelf gedurende drie minuten te verbeteren tot Super Turtles. Ondertussen stuiten de kwaadaardige Shredder en zijn handlangers Bebop en Rocksteady op de Dark Mutastone, die hen verandert in respectievelijk Devil Shredder, Supermutant Bebop en Supermutant Rocksteady. Maar de Turtles hebben nog een trucje in petto: ze kunnen alle vier gecombineerd worden tot hun ultieme vorm: Turtle Saint.

Als die Turtles die Mutastones von Crys-Mu, dem Geist des Lichtes, erhalten, besitzen sie von nun die Fähigkeit sich in Super Turtles zu verwandeln. In der Zwischenzeit stolpern der böse Shredder, Bebop und Rocksteady über den dunklen Mutastone, welcher sie ebenfalls zu Super Kriegern mutieren lässt. Aber was wären die Turtles ohne einen Trick unter ihren Panzern - Alle vier können sich zu einem ultimativen Super Turtle kombinieren - Turtle Saint!