Entre altres coses, en Jeremy ha programat nous vehicles d'alt rendiment, el XANA ha afegit uns quants monstres a la seva col·lecció i l'Aelita, per fi, se n'ha anat a viure al col·legi amb els seus amics. Això sí, el XANA s'ha apoderat d'una casa prop del col·legi des d'on planificarà els seus pròxims atacs.

Jeremie努力寻找新的、更好的方法来对抗 Xana。为此，他为小队开发了新的交通工具。同时他还开发了一种新的圆塔扫描程序，可以即时检测到已激活的圆塔，让 Aelita 得以在现实生活。在适应新生活的同时，全班同学到附近的森林进行了一次科学考察。Ulrich 想和 Yumi 搭档，但她已经和一个叫 William 的人搭档了...

After discovering Aelita's link to the supercomputer and the inability to shut off the supercomputer that stems from it, Jeremie works hard to find new and better ways to fight Xana. To that end, he develops new vehicles for the group. He also develops a new tower-scanning program that instantly detects activated towers, allowing Aelita to live on Earth. While adjusting to her new life, the class takes a trip to the nearby woods for a scientific field trip. Ulrich wants to partner up with Yumi, but she's already partnered up with someone named William.

Des surprises attendent la bande sur Lyoko : Jérémie a programmé des engins ultra performants et XANA a généré de nouveaux monstres.

Malgrado Aelita sia ormai diventata un essere umano, i ragazzi sono impossibilitati a spegnere il supercomputer, a causa del legame che XANA ha creato tra se stesso ed Aelita. Jeremy decide quindi di aggiornare Lyoko, potenziando gli avatar dei compagni e creando dei veicoli che permettano loro di spostarsi più rapidamente nel mondo virtuale. Anche XANA però si è evoluto e ha dato vita ad un nuovo tipo di mostro, la Tarantula. Intanto, al collegio, oltre ad Aelita arriva un nuovo studente, William Dunbar, che si mostra subito attratto da Yumi. Nello stesso momento, Aelita trova i resti di una vecchia casa abbandonata, l'Ermitage, e lì ha delle visioni nelle quali lei appare assieme a un uomo.

Durante sua primeira viagem de campo científica com o resto da turma, Aelita começa a ter visões misteriosas que a levam a uma casa abandonada chamada Hermitage. Em uma preparação nervosa para revelar a Yumi o que sente por ela, Ulrich fica com um pouco de ciúme ao vê-la andando com um novo aluno chamado William.

Lyoko tem umas quantas novidades para os nossos heróis: Jeremy programou veículos espetaculares, e o XANA conta com novos monstros.

A la pandilla de Lyoko le esperan sorpresas: Jérémie ha programado máquinas de alto rendimiento y XANA ha generado nuevos monstruos.