2039年、人类由暖化伴随的海面急剧上升、在陆上失去了庞大版图。犹如与其呼应、云缠雾绕的谜之军舰群“雾之舰队”出现在世界各地的海洋、以搭载之超兵器开始攻击人类船舰。人类投入持盈履满的战力、面临最终决战"大海战"、反在"雾"的压倒性武力前脆弱地落败。全海域、搬运途径都遭"雾之舰队"封锁、政治经济於是崩坏、人类走回疲弊一路───────自"大海战"後七年。士官候补生・千早群像面前浮现了"雾之舰队"的潜水舰"I-401"。该是敌人的"I-401、会对与其MENTAL MODEL"IONA"相逢之群像、以及人类带来什麼呢？

2039年、人類は温暖化に伴う急激な海面上昇により、地上での版図を大きく失った。それに呼応するかのように、霧を纏う謎の軍艦群｢霧の艦隊｣が世界各地の海洋に出現、搭載した超兵器で人類の艦を攻撃し始めた。人類は持ちうる戦力を投入し、最終決戦｢大海戦｣に臨むも、｢霧｣の圧倒的な武力の前に脆くも敗れ去った。全ての海域、運搬経路を｢霧の艦隊｣によって封鎖され、政治経済は崩壊、人類は疲弊の一歩をたどっていた――― ｢大海戦｣から7年。士官候補生・千早群像の前に現れた、｢霧の艦隊｣の潜水艦｢イ401｣。敵であるはずの｢イ401｣、そのメンタルモデル｢イオナ｣との出会いは群像に、そして人類に何をもたらすのか・・・？