It is the year 2030, and the stage is the capital of Japan, Chou-Tokyo. Through "Buddyfight", humans have started cultural interactions with residents from other worlds called "Affinity Dimensions". Buddyfight is a game with selected humans as the "Buddyfighter", and residents from the other world as the partner (known as "Buddy Monster"). These battles have high significance and sometimes it is even used to decide the fate of a nation, and naturally there are those who seek to use the Buddy Monsters for evil purposes.

舞台は2030年頃、日本の首都・超東驚(ちょうとうきょう)。人間は｢バディファイト｣を通じ、｢親近界｣と呼ばれる異世界の住人たちと交流を始めていた。バディファイトとは、選ばれた人間｢バディファイター｣が、異世界の住人(バディモンスター)と相棒となり繰り広げるゲームである。その戦いは、時に国の命運を左右することもあるほど重要で、バディモンスターの力を悪用するものも現れていた。相棒学園初等部6年、未門牙王(みかどがおう)。彼もバディファイトに憧れ、いつかモンスターを相棒にしたいと願っていた。ある日、不良に絡まれている少年を見かけた牙王は、正義感から得意の合気柔術で少年を助け出す。そんな牙王の活躍を遠く異世界から眺めていたモンスターがいた。ドラゴンワールドの英雄の息子、｢ドラムバンカー・ドラゴン｣だ。ドラムは常識破りな牙王を気に入り、バディ(相棒)として契約する。バディモンスターに選ばれた主人公がバディファイトを通じ、相棒や仲間との絆を深め、ともに成長していくストーリー。

É o ano de 2030, e o palco é a capital do Japão, Chou-Tokyo. Através de "Buddyfight", os humanos iniciaram interações culturais com residentes de outros mundos chamados "Dimensões de Afinidade". Buddyfight é um jogo com humanos selecionados como "Buddyfighter" e residentes do outro mundo como parceiros (conhecidos como "Buddy Monster"). Essas batalhas têm grande significado e às vezes até são usadas para decidir o destino de uma nação, e naturalmente há quem procure usar os Buddy Monsters para propósitos malignos.